Elle est chargée de la conception, de la programmation, de la coordination, du suivi et de l'évaluation des actions de développement sanitaire. A ce titre, elle est chargée : 
  

• d'élaborer et suivre la mise en oeuvre de la politique nationale de santé (PNS) et du plan national de développement sanitaire(PNDS) ;
• d'organiser les  revues  sectorielles  (mi-parcours  et  annuelle)  de  mise  en oeuvre du PNDS ;
• d'élaborer  le programme d'activités  consolidé du ministère assorti de projets de lettres de mission pour les structures du département ;
• d'élaborer   les  rapports  d'activités   consolidés  (mi-parcours  et  annuel)  du ministère assortis d 'une évaluation annuelle des performances ; 
• d'animer  les cadres de concertation sectoriels (CASEM) et suivre la mise en oeuvre des recommandations  issues de ces cadres ; 
• de préparer le cadrage sectoriel ; 
• de coordonner et suivre les relations de coopération avec les partenaires ; 
• de contribuer à la mobilisation des financements au profit du ministère ; 
• d'élaborer  le  programme  d 'investissement  du  ministère  et  de  suivre  son exécution ; 
• de suivre et évaluer les projets et programmes et d'élaborer des rapports de leur mise en oeuvre ; 
• d'identifier  et suivre les actions des intervenants extérieurs (autres projets et programmes  de   développement,    organisations   non   gouvernementales, organisations  de la société civile, secteur privé et collectivités territoriales) par des rapports périodiques sur leurs contributions à la mise en oeuvre de la politique  nationale  de santé et le plan national  de développement sanitaire ; 
• collecter et traiter toutes les données statistiques des activités du ministère ; 
• de   promouvoir   et  coordonner   la  recherche   pour   la   santé   au  sein   du département ; 
• de proposer toute étude nécessaire à la dynamique du département. 

La   Direction   générale   des   études   et  des   statistiques  sectorielles comprend: 

• la Direction  de la prospective et de la planification opérationnelle ; 
• la Direction  des statistiques sectorielles ; 
• la Direction  de la formulation  des politiques ; 
• la Direction du suivi, de 1'évaluation et de la capitalisation ; 
• la Direction de la coordination  des projets et programmes.